Dit is een veel voorkomend probleem bij de AVR MEGA reeks, TINY's hebben hier geen last van. De fabrieksinstelling van de AVR staan zo ingesteld dat JTAG enabled is. Door deze instelling is het niet mogelijk om PORTC (waar JTAG zit) normaal te gebruiken. Via de FUSE-bits van de AVR kun je JTAG uit zetten.
